主题
文献 novelty 核查 · 已发表 pQTL-MR 与本课题结果重叠对照
目的：在投稿前核实"UKB-PPP cis-pQTL × FinnGen 眼病/糖尿病并发症 × MR + 共定位 + 复制"这条设计是否已被他人发表。 核查日期 2026-07-22。以下"已发表"部分均核实自原文/摘要并附链接；"含义与建议"部分是分析判断，供与导师讨论。 配套：分家重跑定稿 · 结果 · 方案答疑
一句话结论
本课题的核心设计与头号结果，已被 2024–2025 年发表的多篇论文覆盖——包括几乎一比一的数据源组合（UKB-PPP × FinnGen × MVP/deCODE）、相同的方法（MR + 共定位 + 复制），以及我们的头号候选 TNFRSF10A。作为独立的"发现新靶点"论文，novelty 很弱。
一、已发表的高度重叠论文（核实过）
| # | 论文 | 数据源 | 命中靶点 | 与本课题关系 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Hou 2025, J Ophthalmology（PMC12503973） | UKB-PPP 发现 + deCODE 复制 + FinnGen R11 AMD + MVP 复制 | C3、CFHR2、F13B、MASP1、SIGLEC7、TLR1、PILRB、PILRA、APOE、TGFB1、ECM1、ANXA2 | 设计几乎一比一；其 12 靶点覆盖我们 AMD 共定位命中的 APOE/PILRA/PILRB/TGFB1，及复制命中的 CFHR2/F13B |
| 2 | AMD proteome-wide MR + 共定位, 2024 | pQTL 35,559(deCODE) + 54,219(UKB-PPP)，SMR + 共定位 | TNFRSF10A（5 个风险蛋白之一，Wet-AMD 共定位、共享因果变异，RPE/PKCα 机制）；另 SFTA2/LTA/BRD2/PILRA/ACADSB、COL10A1、WARS1 | 我们的头号候选 TNFRSF10A 已被此文报道；WARS 亦已报 |
| 3 | 糖尿病视网膜病变 plasma proteome screening, Sci Rep 2024 | UKB-PPP + deCODE + FinnGen DR(14,584 例) + Steiger + 贝叶斯共定位 + 表型扫描 | ICAM1、GCKR、WARS | DR 支设计与本课题几乎一样 |
| 4 | 糖尿病多神经病变 MR 药靶, 2024 | pQTL + MR | （神经病变靶点） | 神经支已有专文 |
| 5 | 糖尿病肾病 proteome+genome 整合, 2025 | pQTL + GWAS | （DKD 靶点） | 糖肾支已有专文 |
二、我们的结果 × 已发表：逐蛋白对照
| 我们的命中 | 家族 / 证据 | 是否已被上述文献报道 |
|---|---|---|
| TNFRSF10A | AMD，共定位 PP0.92 + IAMDGC 复制 p=1.6e-9（本课题头号） | ✅ 已报道（#2，AMD 风险蛋白 + Wet-AMD 共定位） |
| APOE | AMD 共定位 + 复制 | ✅ 已报道（#1）+ 已知生物学 |
| PILRA / PILRB | AMD 共定位 | ✅ 已报道（#1、#2） |
| TGFB1 | AMD 共定位 | ✅ 已报道（#1） |
| CFHR2 / F13B | AMD 复制 | ✅ 已报道（#1） |
| WARS | AMD 共定位 | ✅ 已报道（#2 WARS1、#3 DR-WARS，两病都被报过） |
| CFH / CFB / CFI / CFHR5 | AMD 复制 | ⚠️ AMD 补体教科书基因（2005–2016 已定），确认性 |
| CASP10 | AMD 共定位 H4=0.97 | ⚠️ 已系统检索，结论已改：正文层面无人报道，但 Pu 2024 (PMC11187347) 补充表 6–9 里测过，b_SMR=−0.2485（我们 −0.25，几乎逐位吻合），因 HEIDI 拒绝（p=0.035/0.021）+ FDR 0.12 未报。是争议位点，不是新靶点。另 CSC GWAS 预印本 2026 已用 coloc+MR 把循环 CASP10 关联到中浆（且同为 TNFRSF10A/TGFB1/CASP10 三联） |
| CSF2 | AMD 共定位/复制 | ❌ 已被报道，此前判断有误：Pu 2024 正文明列 CSF2 为 Wet-AMD 显著蛋白（FDR 0.0073，HEIDI 0.127 通过） |
| DXO | AMD | ❌ 建议剔除：位于 chr6:31,971,050（MHC 区）；Pu 2024 中 p_SMR=5.9e−14 但 p_HEIDI=3.7e−9 灾难性失败，典型 LD 假象 |
| SPRY2 | AMD | ❓ Pu 2024 四张表中从未显著（最好 FDR 0.088）。可称"未被报道"，但证据弱 |
| APOL1 | 黄斑病变唯一共定位候选（PP 0.81） | ⚠️ 2026-07-27 订正：原写作"糖肾"，实为黄斑病变（本研究中 APOL1 无糖肾显著关联）。APOL1 与肾病的著名关联属既有文献背景，非本研究结果 |
| HCG22 / LTB / TNXB / MICB_MICA | DR 复制的 4 个 | ⚠️ 全在 MHC/HLA 区：cis-pQTL MR 在 MHC 因扩展 LD 极不可靠，严谨研究常剔除；不宜作主结论 |
| AGER（神经）/ BTN2A1（糖肾） | 单一复制命中 | ❓ 未系统核查 |
已发表的 DR 稳健靶点是 ICAM1/GCKR/WARS（#3）；我们的 DR 命中却落在不可靠的 MHC 区——既没复现别人的稳健靶点，自己的命中又在雷区。
三、含义（分析判断，供讨论）
- 不是"证实已知生物学"这么轻，而是分析本身已被做过并发表——设计、数据源、方法、头号结果都被覆盖。
- 计划里设想的差异化，实际很薄：
- FinnGen R13 vs R11 只是增量更新，不构成 novelty；
- 东亚 pQTL 本次实际未用（暴露仍为 UKB-PPP 欧洲）；
- 视网膜 eQTL 组织落位本次基本失败（10 个 A 级靶点三性状齐全共定位 = 0，受 eQTL 区域数据覆盖限制）。
- 作为独立"新靶点发现"论文，审稿人大概率以 novelty 不足拒稿。
四、可行的转向（择一，供与导师讨论）
- ⭐ 干 MR 只作靶点优先级，新意来自原创湿实验：导师有斑马鱼 DR 模型（湿+干正是其强项）。选 1 个靶点在斑马鱼做原创功能验证——把"被抢的干分析"转成"干+湿"新论文，审稿看的是湿实验原创性而非 MR novelty。最契合导师实验室，最可能立得住。
- 转组织特异 / 单细胞驱动（血浆蛋白组已饱和）：用视网膜/RPE eQTL 或单细胞图谱驱动分析——但需先解决视网膜 eQTL 数据可及性（本次数据太薄）。
- 诚实的 replication / consolidation：低档期刊可发，价值有限，不建议作主目标。
五、建议
先暂停对干分析的进一步投入，把上述 novelty 现实如实与导师摊开，重点讨论"选哪个靶点进斑马鱼/细胞做原创验证"，而非"干 MR 怎么再包装"。
👉 可验证的细胞/斑马鱼模型 + 候选→细胞对应 + 参考文献 见 → 实验验证方案 · DR/AMD 细胞与斑马鱼模型
核查局限：本页基于定向检索（Europe PMC / 常规搜索），非系统性文献综述；"未见报道"仅代表定向检索未命中，不等于确证新颖。正式投稿前建议做一次系统检索。