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FinnGen 网址地图 · 数据到底在哪下
FinnGen 网址多得容易晕：下数据、查定义、看结果、读文档是四个不同的站，每个版本还各分一套。 这一页把它们理清，并给出 summary stats / manifest 的确切下载地址。
一句话记忆（按工作流）
| 我要干什么 | 去哪 |
|---|---|
| 下结局 GWAS 文件 · 查 case/control 数 | storage.googleapis.com/finngen-public-data-r9/（R9 公开桶）或填表（R12/R13） |
| 查 endpoint 定义 / 对照口径 | risteys.finngen.fi（Risteys） |
| 在线看单个变异/表型的 GWAS 结果 | r13.finngen.fi（PheWeb 浏览器） |
| 查版本改动 / 发布说明 | docs.finngen.fi（Handbook） |
真正天天用的就两个：下数据的公开桶 和 查定义的 Risteys。其余是查资料用。
二、manifest.tsv 在哪下
manifest = 该 release 所有 summary stats 的总目录，每行一个 endpoint，带 phenocode / name / num_cases / num_controls / path_https（下载链接）。
R9（完全公开，直接 curl）：
bash
# 总目录
https://storage.googleapis.com/finngen-public-data-r9/summary_stats/R9_manifest.tsv
# 查任意 endpoint 的病例/对照数（以糖网为例）
curl -s https://storage.googleapis.com/finngen-public-data-r9/summary_stats/R9_manifest.tsv \
| grep "DM_RETINOPATHY_EXMORE"
# → DM_RETINOPATHY_EXMORE Diabetic retinopathy ... 10413 308633 gs://.../finngen_R9_DM_RETINOPATHY_EXMORE.gz https://.../finngen_R9_DM_RETINOPATHY_EXMORE.gzmanifest 里 path_https 列直接就是每个 .gz 结局文件的下载地址，同一个桶里既有目录也有数据。
R12 / R13 没有匿名公开桶
R9 是完全开放桶，能直接 curl。R12/R13 的公开下载走申请表： 在 finngen.fi/en/access_results 填表 → 邮件会给你 R13 的 GCS 路径和它自己的 manifest。 所以 R13 的 manifest 不在开放网址上，是当初填表拿到的那份。直接 curl R13 桶会报 NoSuchKey。
三、四类网址各管什么
| 网址 | 干什么的 | 何时用 |
|---|---|---|
| storage.googleapis.com/finngen-public-data-r9/ | 真正下数据（sumstats + manifest） | ★ 跑 MR 下结局、查 N —— 主力 |
| finngen.fi（/en/access_results） | 官方门户 + R12/R13 下载申请入口 | 下 R12/R13 数据时填表 |
| docs.finngen.fi（Handbook） | 官方文档、release notes、版本说明 | 查"R13 什么时候发的、改了什么" |
| r9 / r12 / r13 / r14 .finngen.fi | PheWeb GWAS 结果浏览器 | 在线查某变异/表型、看曼哈顿图 |
risteys.finngen.fi（含 r9. / r13. 前缀） | endpoint 定义浏览器（病例/对照/排除口径） | 查"这个 endpoint 怎么定义、对照是谁" |
| finngen.gitbook.io | 旧版公开文档（渐被 docs.finngen.fi 取代） | 偶尔查 R2–R9 老下载说明 |
三个站别搞混
同一份 endpoint，Risteys（定义）、PheWeb（在线结果）、公开桶（可下文件）是三个不同站：
- 查"对照到底是全人群还是糖尿病人" → Risteys：
r13.risteys.finngen.fi/endpoints/<CODE> - 在线看这个 endpoint 的 GWAS 长啥样 → PheWeb：
r13.finngen.fi - 把整份 sumstats 下下来跑 MR → 公开桶 / 申请表
四、两层发布节奏（为什么"R13 已发但下不到"）
FinnGen 分两层：
- 合作方 / Sandbox 层：partner 先拿到（R13 早在 2025 Q2 就给了），甚至已跑到 R14。
- 公开层：滞后约一年才放出。目前能匿名下载的最新是 R9；R12/R13 走申请表；R14 只能在线浏览（
r14.finngen.fi），公开 sumstats 尚未开放。
所以"在线能查 R14" ≠ "能下 R14 全量"。做 MR 需要整份 sumstats，当前实际能跑的最新公开版是 R13（走申请表）。