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糖尿病并发症 · 血浆蛋白因果靶点

本栏目是 R9 主线研究(cis-pQTL 药物靶点孟德尔随机化 → 四个糖尿病并发症)的 成稿材料:现行分析流程、成稿图与发表版表格。

孟德尔随机化 栏目的分工 · mr/方法学与流水线的通用文档(学习指南、配置、历史版本流程、重跑实录) · 本栏目只放这一项研究当前有效的东西

研究对象

四个并发症(FinnGen R9):视网膜病变 · 黄斑病变 · 神经病变 · 肾病。 另设 T1D / T2D 两条糖尿病对照臂,用于区分「并发症特异」与「糖尿病驱动」。 暴露为 UKB-PPP 血浆蛋白组(34,557 人)的 cis-pQTL 哨兵变异。

目录

流程位置
分析流程定稿 v5✅ 现行流程
数据验收F0 · 可选步骤54
[工具选择与 MR](/dm-complications/21-工具选择与 MR)步骤 1–24(+3 补充)8
糖尿病对照臂F-DM37
方向性步骤 3 · ★否决点32
外部复制步骤 4 · 只分流14
[表位与 PAV 调查](/dm-complications/25-表位与 PAV 调查)4X · ★唯一否决点14
通路富集F富 · 旁支12
共定位步骤 5 · 措辞升级关卡32
候选位点放大图步骤 5 · 逐位点11
[靶点 pheWAS 与成药性](/dm-complications/29-靶点 pheWAS 与成药性)步骤 6-1 / 6-2 · 只标注413
跨组学定向验证步骤 6-3 · 只标注5
视网膜单细胞步骤 6-4 · 只标注3
定稿步骤 741

51 张成稿图48 个发表版表格(「↑」= 与上一页共用同一步骤的表)。

跨全流程的数据来源清单:data_sources.csv(每个数据源的版本、样本量与访问方式)。

页面由 tools/gen_docs_r9.pyresults/ 现读生成,不手写 —— 上一次手写的图清单落后了 21 张。图一变,重跑脚本即可。

网页版图片为 1600 px 宽的降采样 PNG;投稿用的 PDF 与 600 dpi TIFF 在仓库里,未随站分发。

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