主题
糖尿病并发症 · 血浆蛋白因果靶点
本栏目是 R9 主线研究(cis-pQTL 药物靶点孟德尔随机化 → 四个糖尿病并发症)的 成稿材料:现行分析流程、成稿图与发表版表格。
与 孟德尔随机化 栏目的分工 ·
mr/是方法学与流水线的通用文档(学习指南、配置、历史版本流程、重跑实录) · 本栏目只放这一项研究当前有效的东西
研究对象
四个并发症(FinnGen R9):视网膜病变 · 黄斑病变 · 神经病变 · 肾病。 另设 T1D / T2D 两条糖尿病对照臂,用于区分「并发症特异」与「糖尿病驱动」。 暴露为 UKB-PPP 血浆蛋白组(34,557 人)的 cis-pQTL 哨兵变异。
目录
| 页 | 流程位置 | 图 | 表 |
|---|---|---|---|
| 分析流程定稿 v5 | ✅ 现行流程 | — | — |
| 数据验收 | F0 · 可选步骤 | 5 | 4 |
| [工具选择与 MR](/dm-complications/21-工具选择与 MR) | 步骤 1–2 | 4(+3 补充) | 8 |
| 糖尿病对照臂 | F-DM | 3 | 7 |
| 方向性 | 步骤 3 · ★否决点 | 3 | 2 |
| 外部复制 | 步骤 4 · 只分流 | 1 | 4 |
| [表位与 PAV 调查](/dm-complications/25-表位与 PAV 调查) | 4X · ★唯一否决点 | 1 | 4 |
| 通路富集 | F富 · 旁支 | 1 | 2 |
| 共定位 | 步骤 5 · 措辞升级关卡 | 3 | 2 |
| 候选位点放大图 | 步骤 5 · 逐位点 | 11 | ↑ |
| [靶点 pheWAS 与成药性](/dm-complications/29-靶点 pheWAS 与成药性) | 步骤 6-1 / 6-2 · 只标注 | 4 | 13 |
| 跨组学定向验证 | 步骤 6-3 · 只标注 | 5 | ↑ |
| 视网膜单细胞 | 步骤 6-4 · 只标注 | 3 | ↑ |
| 定稿 | 步骤 7 | 4 | 1 |
共 51 张成稿图、48 个发表版表格(「↑」= 与上一页共用同一步骤的表)。
跨全流程的数据来源清单:data_sources.csv(每个数据源的版本、样本量与访问方式)。
页面由
tools/gen_docs_r9.py从results/现读生成,不手写 —— 上一次手写的图清单落后了 21 张。图一变,重跑脚本即可。
网页版图片为 1600 px 宽的降采样 PNG;投稿用的 PDF 与 600 dpi TIFF 在仓库里,未随站分发。