主题
发表规划 · 正文 vs 补充材料分配
把本课题的图/表/分析，按高分 SCI 的常规体例分配到正文（Main）与补充材料（Supplementary）。
这是投稿规划建议，最终以目标期刊的图表数量上限与体例为准（多数期刊正文 ≤ 6 主图 + 1–2 主表）。配套：近5年相似文献对照 · 文献 novelty 核查。
分配原则
正文 = 讲清"因果 + 独立复制 + 功能"这条主线的最少图表；补充 = 支撑性的完整结果、稳健性检验、方法细节、阴性结果。凡"非独立稳健性对照""全量结果""次要/翻转靶点明细"一律进补充。
一、正文（Main Text）
| # | 内容 | 出处 |
|---|---|---|
| Fig 1 | 研究设计示意图（暴露 UKB-PPP cis-pQTL → FinnGen R13 结局 → MR+共定位 → 独立复制 → 多组学/功能） | 新绘 |
| Fig 2 | 发现层：显著 cis-pQTL MR 火山/森林（AMD + DR 并排；标注头号靶点） | pqtl_volcano/forest_* |
| Fig 3 | 共定位：优先靶点区域共定位图（TNFRSF10A、CFH、AGER 等核心候选） | locus_*、hyprcoloc |
| Fig 4 | 独立复制：IAMDGC（AMD 73%、补体 100%）+ deCODE 平台复制散点（全 34 靶点） | decode_rep/decode_vs_ukb_scatter |
| Fig 5 | 功能/多组学收敛：单细胞定位 + eQTL/meQTL + 通讯/轨迹（主打靶点，如 MERTK/TNFRSF10A） | scrna_*、eqtl/smr |
| Table 1 | 优先因果靶点总表：MR（β/OR/FDR）+ 共定位 PP + 复制 + 成药性 | 靶点证据总表 |
二、补充材料（Supplementary）
| 类别 | 内容 | 出处 |
|---|---|---|
| 完整结果 | 全蛋白 × 全结局筛查表（~1,659 蛋白 × N 结局，含不显著） | screen_R13_*/*_all.csv |
| 外部对照（非独立） | SCALLOP-UKBB-MA cis 对照全表（含 UKB-PPP → 稳健性而非独立复制） | 外部pQTL对照-SCALLOP |
| 平台复制明细 | deCODE 全 34 靶点表 + 6 个方向翻转蛋白（TGFB1/CSF2/CTRL/FABP6/FGFR2/PON1） | decode_rep_mr.csv / 柱状图 |
| 遗传相关 | LDSC 遗传相关矩阵、遗传力（AMD 亚型、并发症 vs T1D/T2D） | ldsc_* |
| 稳健性 | Steiger 定向、F 统计（弱工具）、MR-Egger/加权中位数、异质性 | 各 *_sensitivity |
| 质控/方法 | MHC 区 LD 假象剔除、谐化/等位翻转、数据版本与坐标系 | 方法学审计 |
| 多组学补充层 | 代谢物 MR、甲基化 SMR（非核心结论时） | multiomics-mr |
| 阴性结果 | DR 共定位阴性、新生血管性青光眼 0 显著、功能层阴性 | 各结果页 |
三、关键取舍说明
- SCALLOP 进补充、不进正文：它含 UKB-PPP、非独立，只能作稳健性对照（见 SCALLOP 页发表策略）。正文的"复制"由 IAMDGC + deCODE 承担。
- deCODE 正文只放"核心候选 + 汇总统计（79.4%/83.6%）+ 散点"；全 34 靶点表与 6 个翻转蛋白进补充——正文不被次要/翻转靶点稀释。
- 6 个跨平台翻转蛋白（TGFB1/CSF2 表位假象 + CTRL/FABP6/FGFR2/PON1 弱工具）明确在补充中标注、正文一句话带过，不与核心靶点并列。
- 阴性结果如实进补充（不藏）：DR 共定位稀疏、NVGlaucoma 0 显著、部分功能层阴性——这是方法严谨的体现。