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14 · 糖尿病视网膜病变(DR)建模与表型读出 SOP

13 得到 KO/crispant 后,本文教你造 DR 模型 + 四类读出(血管成像 / 组织学+免疫染色 / qPCR+WB / ERG+OKR+单细胞)对比 KO vs WT。 参数标注同 13:【文献】/【常用值】。引用见 15


A. 高血糖(DR)建模

斑马鱼 DR 模型有两条主线,新手先用葡萄糖浸泡(幼鱼)最快

A1. 葡萄糖浸泡 — 幼鱼快速模型(首选,几天出血管表型)

  • 原理/证据:3 dpf 起浸泡高糖,几天内出现视网膜/玻璃体血管改变、VEGF 上调(Jung 等"斑马鱼 DR 筛选模型" Biomed Pharmacother 2021; 综述 Wiggenhauser & Hammes 2021)。
  • 操作
    1. 3 dpf 幼鱼置 葡萄糖溶液中浸泡;常用浓度区间 ~50–130 mM【文献,按目的选】(报道中 130 mM 组血管直径明显增大;≥160 mM 出现形态改变可能过强)。
    2. 关键对照:等摩尔 甘露醇组(排除高渗效应) + 正常 E3 组。
    3. 交替浸泡降低毒性:高糖↔养液交替(部分方案每天换),记录存活。
    4. 5–6 dpf 起读表型(血管成像/qPCR)。
  • 成体长期模型:成鱼交替浸泡葡萄糖约 30 天可致 IPL/INL 变薄(Gleeson et al., 2007)——做神经退行/慢性表型时用。

A2. 遗传模型 pdx1⁻/⁻(稳定、贴近"真糖尿病")

  • 原理:CRISPR 敲除胰腺转录因子 pdx1 → 胰腺发育异常、持续高血糖 → 视网膜血管新生激活(Wiggenhauser et al., 2020, Diabetes)。
  • 用途:需要稳定糖尿病背景时;可与你的候选基因 KO 杂交做上位分析。

选择建议:预实验/筛表型用 A1 幼鱼葡萄糖浸泡(快、便宜);机制/慢性用 A2 或成体 A1


B. 读出一 · 血管成像(必做,斑马鱼最大优势)

B1. 活体荧光血管成像

  • 品系Tg(fli1:EGFP)——fli1 启动子驱动 EGFP 标记全部血管内皮(Lawson & Weinstein, 2002, Dev Biol)。把你的候选基因 KO/crispant 做在该荧光背景上(注射到该品系胚胎,或杂交)。
  • 操作
    1. PTU 抑色素;成像前 MS-222 麻醉。
    2. 低熔点琼脂糖 0.8–1.2% 包埋幼鱼,侧卧固定于玻底皿。
    3. 激光共聚焦(Zeiss LSM/Leica SP8) z-stack 扫眼部,三维重建玻璃体/视网膜血管。
  • 量化指标(用 ImageJ/Fiji):血管直径、血管密度、分支点数、玻璃体血管(hyaloid)形态、无灌注区、新生血管出芽。高糖下典型为血管直径增大、VEGF 上调(幼鱼模型)。

B2. 成体视网膜血管铺片(更精细的血管定量)

  • 成鱼取眼 → 显微解剖分离视网膜 → tg(fli:EGFP) 荧光下铺片成像与定量(JoVE 56674: "Studying Diabetes Through the Eyes of a Fish")。

C. 读出二 · 组织学 + 免疫染色

  1. 固定:4% PFA 4 ℃ 过夜。
  2. 切片:石蜡或冰冻切片(冰冻需蔗糖梯度脱水 + OCT 包埋),取眼球过视神经的矢状/横切面
  3. 常规组织学:HE 染色 → 测视网膜分层厚度(IPL/INL/外核层等)、感光细胞层。高糖慢性模型可见 IPL/INL 变薄(Gleeson et al., 2007)。
  4. 免疫荧光(IF)/免疫组化(IHC)
    标记抗体看什么
    血管内皮anti-GFP(增强) / isolectin B4血管
    视锥zpr-1(ZIRC)视锥细胞
    视杆外节zpr-3(ZIRC)视杆/外节退行
    增殖PCNA / EdU(Click-iT)Müller 细胞再生反应
    凋亡TUNEL 试剂盒神经元死亡
    胶质GFAP / 谷氨酰胺合成酶Müller 细胞活化
  5. 共聚焦/荧光显微镜成像,ImageJ 定量阳性细胞数/荧光强度/层厚。

D. 读出三 · 分子(qPCR + Western blot)

D1. qPCR(mRNA 表达)

  1. 取材(整胚或解剖眼组织,n≥3 窝,每样数十胚池样)→ TRIzol 提总 RNA。
  2. 反转录(🇨🇳 诺唯赞 HiScript) → SYBR qPCR(ChamQ)。
  3. 目标基因:你的候选基因(确认敲低)、VEGF(vegfaa)、缺氧 hif1、炎症(il1b、tnfa、il6)、血管标志(kdrl、cdh5)、内参(actb1、rpl13a、ef1a)。
  4. 2^−ΔΔCt 法相对定量,KO vs WT 对比。

D2. Western blot(蛋白)

  • 验证候选基因蛋白下降及通路蛋白(如 VEGF、HIF-1α、磷酸化通路);眼/全胚裂解,标准 SDS-PAGE → 转膜 → 抗体孵育 → 化学发光。

E. 读出四 · 视觉功能 + 单细胞(进阶/冲高分)

E1. OKR 视动反应(无创、快速筛功能)

  • 原理:旋转条纹诱发眼动反射,4 dpf 起可测,每尾约 1 min(Brockerhoff, 2006, Nat Protoc)。
  • 操作:6% 甲基纤维素固定幼鱼于皿中,外周旋转条纹鼓 + 摄像记录眼动;可测视敏度/对比敏感度。

E2. ERG 视网膜电图(视网膜功能金标准)

  • 原理:光刺激下记录视网膜总和电位,反映外层视网膜功能。可用自建或商品装置对完整幼鱼无创记录(Makhankov et al., 2004, J Neurosci Methods;幼鱼 ERG 见 JoVE 52662)。
  • 操作要点:暗适应 → 麻醉/固定 → 微电极置角膜 → 给闪光 → 记录 a 波/b 波振幅与潜伏期,KO vs WT 比。

E3. 单细胞/空间转录组(机制 + 高分)

  • 解离 KO vs WT 视网膜(高糖 vs 正常)→ 10x Genomics 建库 → 测序(🇨🇳 诺禾致源/华大)→ Seurat 分析细胞亚群、状态转变(尤其 Müller 细胞、内皮、神经元)、差异通路。这块正好用你干实验线(07)的生信技能

F. 统计与作图

  • 正态/方差齐性检验 → 两组用 t 检验、多组用单因素 ANOVA + 事后检验;非正态用非参数检验。
  • 生物学重复 ≥3,报告精确 n、均值±SD/SEM、确切 P 值。
  • 作图:GraphPad Prism;图像排版 Illustrator/Inkscape;机制示意图 BioRender。
  • 报告规范参考动物实验 ARRIVE 指南

G. 一个完整验证实验的最小组合(建议先做这套出预实验)

  1. 候选基因 crispant 做在 Tg(fli1:EGFP) 上 + tyr 阳性对照 + scrambled 对照 (13)
  2. 3 dpf 起葡萄糖浸泡(含甘露醇渗透对照) (A1)
  3. 5–6 dpf 共聚焦血管成像 + ImageJ 定量 (B1)
  4. qPCR 测候选基因↓ 与 vegfaa/炎症因子变化 (D1)
  5. HRMA 确认敲除效率 (13 步骤 6)
  6. n≥3 窝,Prism 统计作图 (F)

→ 这套数据足够写进基金本子和第一篇论文的预实验部分。后续按需加切片/IHC、ERG、单细胞、稳定系、rescue。

引用全部见 15-参考文献.md

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